Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG68

TTL, Tubulin--tyrosine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLQ8NG68 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLQ8NG68 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTLQ8NG68 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms