Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDDC3Q8N4P3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDDC3Q8N4P3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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