Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ8

SUGP1, SURP and G-patch domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUGP1Q8IWZ8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUGP1Q8IWZ8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SUGP1Q8IWZ8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUGP1Q8IWZ8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUGP1Q8IWZ8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUGP1Q8IWZ8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUGP1Q8IWZ8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SUGP1Q8IWZ8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUGP1Q8IWZ8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUGP1Q8IWZ8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms