Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM139Q8IV31 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms