Protein–RNA interactions for Protein: Q86YR7

MCF2L2, Probable guanine nucleotide exchange factor MCF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2L2Q86YR7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCF2L2Q86YR7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCF2L2Q86YR7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms