Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC11Q7Z392 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC11Q7Z392 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms