Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC30Q5VVM6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC30Q5VVM6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms