Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBAP2Q5T6F2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBAP2Q5T6F2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UBAP2Q5T6F2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBAP2Q5T6F2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBAP2Q5T6F2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBAP2Q5T6F2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBAP2Q5T6F2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBAP2Q5T6F2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBAP2Q5T6F2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBAP2Q5T6F2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBAP2Q5T6F2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBAP2Q5T6F2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBAP2Q5T6F2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBAP2Q5T6F2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBAP2Q5T6F2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBAP2Q5T6F2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBAP2Q5T6F2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBAP2Q5T6F2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBAP2Q5T6F2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms