Protein–RNA interactions for Protein: Q5GJ75

TNFAIP8L3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8L3Q5GJ75 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms