Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP25-1Q3LHN0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP25-1Q3LHN0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP25-1Q3LHN0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP25-1Q3LHN0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP25-1Q3LHN0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP25-1Q3LHN0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP25-1Q3LHN0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP25-1Q3LHN0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP25-1Q3LHN0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP25-1Q3LHN0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP25-1Q3LHN0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP25-1Q3LHN0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP25-1Q3LHN0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP25-1Q3LHN0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP25-1Q3LHN0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP25-1Q3LHN0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms