Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FXNQ16595 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FXNQ16595 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FXNQ16595 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FXNQ16595 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FXNQ16595 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FXNQ16595 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FXNQ16595 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FXNQ16595 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FXNQ16595 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FXNQ16595 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FXNQ16595 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FXNQ16595 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FXNQ16595 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FXNQ16595 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FXNQ16595 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FXNQ16595 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FXNQ16595 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FXNQ16595 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FXNQ16595 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FXNQ16595 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FXNQ16595 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FXNQ16595 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FXNQ16595 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FXNQ16595 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FXNQ16595 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FXNQ16595 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FXNQ16595 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FXNQ16595 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FXNQ16595 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FXNQ16595 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FXNQ16595 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FXNQ16595 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FXNQ16595 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FXNQ16595 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FXNQ16595 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FXNQ16595 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FXNQ16595 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FXNQ16595 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FXNQ16595 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FXNQ16595 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FXNQ16595 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FXNQ16595 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FXNQ16595 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FXNQ16595 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FXNQ16595 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FXNQ16595 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FXNQ16595 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FXNQ16595 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FXNQ16595 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FXNQ16595 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FXNQ16595 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FXNQ16595 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FXNQ16595 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FXNQ16595 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FXNQ16595 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FXNQ16595 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FXNQ16595 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FXNQ16595 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FXNQ16595 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FXNQ16595 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FXNQ16595 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FXNQ16595 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FXNQ16595 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FXNQ16595 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FXNQ16595 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FXNQ16595 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FXNQ16595 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FXNQ16595 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FXNQ16595 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FXNQ16595 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FXNQ16595 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FXNQ16595 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FXNQ16595 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FXNQ16595 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FXNQ16595 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FXNQ16595 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FXNQ16595 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FXNQ16595 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FXNQ16595 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FXNQ16595 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FXNQ16595 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FXNQ16595 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FXNQ16595 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FXNQ16595 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FXNQ16595 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FXNQ16595 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FXNQ16595 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FXNQ16595 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FXNQ16595 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FXNQ16595 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FXNQ16595 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FXNQ16595 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FXNQ16595 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FXNQ16595 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FXNQ16595 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FXNQ16595 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FXNQ16595 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FXNQ16595 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FXNQ16595 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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