Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLF9Q13886 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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