Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNA1Q09470 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.1 ms