Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms