Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPD2P62316 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPD2P62316 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPD2P62316 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPD2P62316 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPD2P62316 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPD2P62316 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPD2P62316 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPD2P62316 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPD2P62316 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPD2P62316 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPD2P62316 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPD2P62316 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPD2P62316 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPD2P62316 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPD2P62316 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPD2P62316 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPD2P62316 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPD2P62316 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPD2P62316 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPD2P62316 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPD2P62316 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPD2P62316 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPD2P62316 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPD2P62316 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPD2P62316 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPD2P62316 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPD2P62316 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms