Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCE1P61221 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCE1P61221 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms