Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP107P57740 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP107P57740 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP107P57740 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP107P57740 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP107P57740 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP107P57740 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP107P57740 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP107P57740 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP107P57740 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP107P57740 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP107P57740 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP107P57740 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP107P57740 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP107P57740 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP107P57740 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP107P57740 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP107P57740 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP107P57740 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP107P57740 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP107P57740 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP107P57740 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP107P57740 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP107P57740 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP107P57740 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP107P57740 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP107P57740 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP107P57740 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP107P57740 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP107P57740 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP107P57740 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP107P57740 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP107P57740 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP107P57740 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP107P57740 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP107P57740 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP107P57740 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP107P57740 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP107P57740 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP107P57740 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP107P57740 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP107P57740 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP107P57740 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP107P57740 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP107P57740 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP107P57740 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP107P57740 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP107P57740 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP107P57740 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP107P57740 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP107P57740 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP107P57740 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP107P57740 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP107P57740 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP107P57740 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP107P57740 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP107P57740 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP107P57740 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP107P57740 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP107P57740 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP107P57740 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP107P57740 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP107P57740 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP107P57740 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP107P57740 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP107P57740 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP107P57740 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP107P57740 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP107P57740 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP107P57740 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP107P57740 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP107P57740 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP107P57740 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP107P57740 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP107P57740 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP107P57740 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP107P57740 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP107P57740 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP107P57740 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP107P57740 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP107P57740 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP107P57740 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP107P57740 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP107P57740 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP107P57740 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP107P57740 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP107P57740 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP107P57740 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP107P57740 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP107P57740 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP107P57740 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP107P57740 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP107P57740 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP107P57740 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP107P57740 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP107P57740 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP107P57740 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP107P57740 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP107P57740 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP107P57740 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms