Protein–RNA interactions for Protein: P53805

RCAN1, Calcipressin-1, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN1P53805 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RCAN1P53805 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RCAN1P53805 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RCAN1P53805 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RCAN1P53805 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RCAN1P53805 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RCAN1P53805 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RCAN1P53805 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RCAN1P53805 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RCAN1P53805 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RCAN1P53805 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RCAN1P53805 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RCAN1P53805 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RCAN1P53805 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RCAN1P53805 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RCAN1P53805 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RCAN1P53805 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RCAN1P53805 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RCAN1P53805 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RCAN1P53805 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RCAN1P53805 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms