Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
REG1BP48304 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
REG1BP48304 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
REG1BP48304 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
REG1BP48304 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
REG1BP48304 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
REG1BP48304 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
REG1BP48304 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
REG1BP48304 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
REG1BP48304 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
REG1BP48304 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
REG1BP48304 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
REG1BP48304 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
REG1BP48304 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
REG1BP48304 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
REG1BP48304 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
REG1BP48304 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
REG1BP48304 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
REG1BP48304 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
REG1BP48304 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
REG1BP48304 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
REG1BP48304 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
REG1BP48304 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
REG1BP48304 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
REG1BP48304 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
REG1BP48304 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
REG1BP48304 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
REG1BP48304 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
REG1BP48304 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
REG1BP48304 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
REG1BP48304 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
REG1BP48304 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
REG1BP48304 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
REG1BP48304 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
REG1BP48304 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
REG1BP48304 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
REG1BP48304 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
REG1BP48304 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
REG1BP48304 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
REG1BP48304 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
REG1BP48304 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
REG1BP48304 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
REG1BP48304 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
REG1BP48304 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
REG1BP48304 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
REG1BP48304 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
REG1BP48304 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
REG1BP48304 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
REG1BP48304 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
REG1BP48304 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
REG1BP48304 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
REG1BP48304 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
REG1BP48304 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
REG1BP48304 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
REG1BP48304 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
REG1BP48304 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
REG1BP48304 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
REG1BP48304 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
REG1BP48304 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
REG1BP48304 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
REG1BP48304 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
REG1BP48304 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
REG1BP48304 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
REG1BP48304 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
REG1BP48304 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
REG1BP48304 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
REG1BP48304 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
REG1BP48304 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
REG1BP48304 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
REG1BP48304 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
REG1BP48304 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
REG1BP48304 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
REG1BP48304 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
REG1BP48304 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
REG1BP48304 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
REG1BP48304 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
REG1BP48304 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
REG1BP48304 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
REG1BP48304 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
REG1BP48304 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
REG1BP48304 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
REG1BP48304 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
REG1BP48304 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
REG1BP48304 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
REG1BP48304 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
REG1BP48304 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
REG1BP48304 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
REG1BP48304 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
REG1BP48304 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
REG1BP48304 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
REG1BP48304 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
REG1BP48304 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
REG1BP48304 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
REG1BP48304 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
REG1BP48304 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
REG1BP48304 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
REG1BP48304 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
REG1BP48304 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
REG1BP48304 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
REG1BP48304 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms