Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHKA1P46020 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHKA1P46020 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHKA1P46020 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHKA1P46020 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHKA1P46020 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PHKA1P46020 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PHKA1P46020 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms