Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNT3P45378 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT3P45378 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms