Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 MHR1YDR296W 681 nt5.38□□□□□ -1.55
VFA1P40080 YDR417CYDR417C 372 nt5.38□□□□□ -1.55
VFA1P40080 RPL12AYEL054C 498 nt5.38□□□□□ -1.55
VFA1P40080 SKI6YGR195W 741 nt5.38□□□□□ -1.55
VFA1P40080 BGL2YGR282C 942 nt5.38□□□□□ -1.55
VFA1P40080 TLG2YOL018C 1194 nt5.38□□□□□ -1.55
VFA1P40080 SER1YOR184W 1188 nt5.38□□□□□ -1.55
VFA1P40080 YDC1YPL087W 954 nt5.38□□□□□ -1.55
VFA1P40080 PAL1YDR348C 1500 nt5.38□□□□□ -1.55
VFA1P40080 YPK3YBR028C 1578 nt5.38□□□□□ -1.55
VFA1P40080 MET7YOR241W 1647 nt5.37□□□□□ -1.55
VFA1P40080 IPI3YNL182C 1668 nt5.37□□□□□ -1.55
VFA1P40080 YDL183CYDL183C 963 nt5.37□□□□□ -1.55
VFA1P40080 HSP31YDR533C 714 nt5.37□□□□□ -1.55
VFA1P40080 TRX2YGR209C 315 nt5.37□□□□□ -1.55
VFA1P40080 YLR311CYLR311C 348 nt5.37□□□□□ -1.55
VFA1P40080 BUB3YOR026W 1026 nt5.37□□□□□ -1.55
VFA1P40080 ANT1YPR128C 987 nt5.37□□□□□ -1.55
VFA1P40080 UBX7YBR273C 1311 nt5.37□□□□□ -1.55
VFA1P40080 SMP1YBR182C 1359 nt5.37□□□□□ -1.55
VFA1P40080 YJR015WYJR015W 1533 nt5.37□□□□□ -1.55
VFA1P40080 NSI1YDR026C 1713 nt5.37□□□□□ -1.55
VFA1P40080 RRN3YKL125W 1884 nt5.37□□□□□ -1.55
VFA1P40080 MNN10YDR245W 1182 nt5.36□□□□□ -1.55
VFA1P40080 GAT4YIR013C 366 nt5.36□□□□□ -1.55
VFA1P40080 YJL171CYJL171C 1191 nt5.36□□□□□ -1.55
VFA1P40080 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt5.36□□□□□ -1.55
VFA1P40080 SNO1YMR095C 675 nt5.36□□□□□ -1.55
VFA1P40080 LTO1YNL260C 597 nt5.36□□□□□ -1.55
VFA1P40080 VAM3YOR106W 852 nt5.36□□□□□ -1.55
VFA1P40080 SIP5YMR140W 1470 nt5.36□□□□□ -1.55
VFA1P40080 SPC97YHR172W 2472 nt5.36□□□□□ -1.55
VFA1P40080 FHL1YPR104C 2811 nt5.36□□□□□ -1.55
VFA1P40080 DBF4YDR052C 2115 nt5.35□□□□□ -1.55
VFA1P40080 SET5YHR207C 1581 nt5.35□□□□□ -1.55
VFA1P40080 FAU1YER183C 636 nt5.35□□□□□ -1.55
VFA1P40080 RPN12YFR052W 825 nt5.35□□□□□ -1.55
VFA1P40080 MRP13YGR084C 1020 nt5.35□□□□□ -1.55
VFA1P40080 NSG1YHR133C 876 nt5.35□□□□□ -1.55
VFA1P40080 MRPL6YHR147C 645 nt5.35□□□□□ -1.55
VFA1P40080 YLR225CYLR225C 1224 nt5.35□□□□□ -1.55
VFA1P40080 ZPS1YOL154W 750 nt5.35□□□□□ -1.55
VFA1P40080 MUP3YHL036W 1641 nt5.34□□□□□ -1.55
VFA1P40080 DEG1YFL001W 1329 nt5.34□□□□□ -1.55
VFA1P40080 DSD1YGL196W 1287 nt5.34□□□□□ -1.55
VFA1P40080 DAN1YJR150C 897 nt5.34□□□□□ -1.55
VFA1P40080 MRT4YKL009W 711 nt5.34□□□□□ -1.55
VFA1P40080 MDG1YNL173C 1101 nt5.34□□□□□ -1.55
VFA1P40080 IRC14YOR135C 342 nt5.34□□□□□ -1.55
VFA1P40080 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.34□□□□□ -1.55
VFA1P40080 HXT4YHR092C 1731 nt5.34□□□□□ -1.56
VFA1P40080 YHL012WYHL012W 1482 nt5.33□□□□□ -1.56
VFA1P40080 MMT2YPL224C 1455 nt5.33□□□□□ -1.56
VFA1P40080 YJR124CYJR124C 1347 nt5.33□□□□□ -1.56
VFA1P40080 SDA1YGR245C 2304 nt5.33□□□□□ -1.56
VFA1P40080 YDL026WYDL026W 312 nt5.33□□□□□ -1.56
VFA1P40080 ADH4YGL256W 1149 nt5.33□□□□□ -1.56
VFA1P40080 YHR022CYHR022C 771 nt5.33□□□□□ -1.56
VFA1P40080 DSC2YOL073C 969 nt5.33□□□□□ -1.56
VFA1P40080 GLT1YDL171C 6438 nt5.33□□□□□ -1.56
VFA1P40080 UGA2YBR006W 1494 nt5.32□□□□□ -1.56
VFA1P40080 GCN20YFR009W 2259 nt5.32□□□□□ -1.56
VFA1P40080 RSM10YDR041W 612 nt5.32□□□□□ -1.56
VFA1P40080 YLR326WYLR326W 723 nt5.32□□□□□ -1.56
VFA1P40080 YIM2YMR151W 438 nt5.32□□□□□ -1.56
VFA1P40080 PPG1YNR032W 1107 nt5.32□□□□□ -1.56
VFA1P40080 SSP2YOR242C 1116 nt5.32□□□□□ -1.56
VFA1P40080 YPR015CYPR015C 744 nt5.32□□□□□ -1.56
VFA1P40080 YSA1YBR111C 696 nt5.32□□□□□ -1.56
VFA1P40080 CDC28YBR160W 897 nt5.32□□□□□ -1.56
VFA1P40080 BUD22YMR014W 1560 nt5.32□□□□□ -1.56
VFA1P40080 FOB1YDR110W 1701 nt5.31□□□□□ -1.56
VFA1P40080 YIL067CYIL067C 2037 nt5.31□□□□□ -1.56
VFA1P40080 YDR222WYDR222W 1248 nt5.31□□□□□ -1.56
VFA1P40080 YDR445CYDR445C 408 nt5.31□□□□□ -1.56
VFA1P40080 AUA1YFL010W-A 285 nt5.31□□□□□ -1.56
VFA1P40080 TIM21YGR033C 720 nt5.31□□□□□ -1.56
VFA1P40080 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt5.31□□□□□ -1.56
VFA1P40080 BUD28YLR062C 378 nt5.31□□□□□ -1.56
VFA1P40080 GEP5YLR091W 882 nt5.31□□□□□ -1.56
VFA1P40080 TRS33YOR115C 807 nt5.31□□□□□ -1.56
VFA1P40080 MET16YPR167C 786 nt5.31□□□□□ -1.56
VFA1P40080 UBS1YBR165W 834 nt5.31□□□□□ -1.56
VFA1P40080 DAL81YIR023W 2913 nt5.31□□□□□ -1.56
VFA1P40080 UBP9YER098W 2265 nt5.3□□□□□ -1.56
VFA1P40080 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt5.3□□□□□ -1.56
VFA1P40080 DBP8YHR169W 1296 nt5.3□□□□□ -1.56
VFA1P40080 PRM9YAR031W 897 nt5.3□□□□□ -1.56
VFA1P40080 snR17bsnR17b 332 nt5.3□□□□□ -1.56
VFA1P40080 AME1YBR211C 975 nt5.3□□□□□ -1.56
VFA1P40080 TGL1YKL140W 1647 nt5.3□□□□□ -1.56
VFA1P40080 YOR1YGR281W 4434 nt5.3□□□□□ -1.56
VFA1P40080 ATG1YGL180W 2694 nt5.3□□□□□ -1.56
VFA1P40080 NDC1YML031W 1968 nt5.29□□□□□ -1.56
VFA1P40080 FAP1YNL023C 2898 nt5.29□□□□□ -1.56
VFA1P40080 YJL206CYJL206C 2277 nt5.29□□□□□ -1.56
VFA1P40080 IBA57YJR122W 1494 nt5.29□□□□□ -1.56
VFA1P40080 YDR161WYDR161W 1164 nt5.29□□□□□ -1.56
VFA1P40080 YDR282CYDR282C 1245 nt5.29□□□□□ -1.56
VFA1P40080 NHP6AYPR052C 282 nt5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.2 ms