Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPA3P35244 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPA3P35244 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPA3P35244 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPA3P35244 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPA3P35244 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPA3P35244 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPA3P35244 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPA3P35244 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPA3P35244 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPA3P35244 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPA3P35244 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPA3P35244 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPA3P35244 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPA3P35244 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPA3P35244 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPA3P35244 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPA3P35244 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPA3P35244 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPA3P35244 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPA3P35244 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPA3P35244 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPA3P35244 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPA3P35244 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPA3P35244 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPA3P35244 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPA3P35244 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPA3P35244 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPA3P35244 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPA3P35244 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPA3P35244 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPA3P35244 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPA3P35244 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPA3P35244 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPA3P35244 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPA3P35244 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPA3P35244 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPA3P35244 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPA3P35244 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RPA3P35244 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPA3P35244 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPA3P35244 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPA3P35244 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPA3P35244 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPA3P35244 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPA3P35244 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPA3P35244 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPA3P35244 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPA3P35244 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPA3P35244 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPA3P35244 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPA3P35244 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPA3P35244 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPA3P35244 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPA3P35244 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPA3P35244 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPA3P35244 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPA3P35244 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPA3P35244 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPA3P35244 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPA3P35244 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPA3P35244 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPA3P35244 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPA3P35244 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPA3P35244 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPA3P35244 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPA3P35244 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPA3P35244 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RPA3P35244 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPA3P35244 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPA3P35244 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RPA3P35244 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPA3P35244 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPA3P35244 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPA3P35244 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPA3P35244 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPA3P35244 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPA3P35244 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPA3P35244 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPA3P35244 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPA3P35244 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPA3P35244 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPA3P35244 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPA3P35244 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPA3P35244 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPA3P35244 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPA3P35244 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPA3P35244 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPA3P35244 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPA3P35244 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPA3P35244 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPA3P35244 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPA3P35244 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPA3P35244 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPA3P35244 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPA3P35244 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPA3P35244 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RPA3P35244 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPA3P35244 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPA3P35244 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms