Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ABCC1P33527 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ABCC1P33527 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ABCC1P33527 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ABCC1P33527 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
ABCC1P33527 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
ABCC1P33527 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ABCC1P33527 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ABCC1P33527 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ABCC1P33527 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ABCC1P33527 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ABCC1P33527 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
ABCC1P33527 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ABCC1P33527 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ABCC1P33527 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
ABCC1P33527 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
ABCC1P33527 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
ABCC1P33527 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
ABCC1P33527 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
ABCC1P33527 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC34.76■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ABCC1P33527 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms