Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA6P31267 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms