Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFNA1P20827 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms