Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA6AP0CW24 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms