Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
F13BP05160 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
F13BP05160 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
F13BP05160 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
F13BP05160 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
F13BP05160 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
F13BP05160 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
F13BP05160 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
F13BP05160 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
F13BP05160 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
F13BP05160 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
F13BP05160 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
F13BP05160 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
F13BP05160 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
F13BP05160 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
F13BP05160 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
F13BP05160 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
F13BP05160 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
F13BP05160 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
F13BP05160 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
F13BP05160 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
F13BP05160 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
F13BP05160 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
F13BP05160 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
F13BP05160 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
F13BP05160 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
F13BP05160 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
F13BP05160 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
F13BP05160 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
F13BP05160 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
F13BP05160 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
F13BP05160 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
F13BP05160 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
F13BP05160 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
F13BP05160 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
F13BP05160 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
F13BP05160 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
F13BP05160 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
F13BP05160 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
F13BP05160 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
F13BP05160 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
F13BP05160 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
F13BP05160 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
F13BP05160 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
F13BP05160 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
F13BP05160 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
F13BP05160 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
F13BP05160 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
F13BP05160 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
F13BP05160 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
F13BP05160 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
F13BP05160 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
F13BP05160 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
F13BP05160 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
F13BP05160 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
F13BP05160 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
F13BP05160 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
F13BP05160 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
F13BP05160 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
F13BP05160 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
F13BP05160 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
F13BP05160 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
F13BP05160 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
F13BP05160 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
F13BP05160 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
F13BP05160 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
F13BP05160 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
F13BP05160 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
F13BP05160 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
F13BP05160 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
F13BP05160 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
F13BP05160 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
F13BP05160 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
F13BP05160 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
F13BP05160 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
F13BP05160 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
F13BP05160 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
F13BP05160 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
F13BP05160 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
F13BP05160 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
F13BP05160 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
F13BP05160 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
F13BP05160 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
F13BP05160 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
F13BP05160 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
F13BP05160 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
F13BP05160 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
F13BP05160 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
F13BP05160 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
F13BP05160 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
F13BP05160 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
F13BP05160 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
F13BP05160 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
F13BP05160 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
F13BP05160 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
F13BP05160 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
F13BP05160 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
F13BP05160 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
F13BP05160 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
F13BP05160 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms