Protein–RNA interactions for Protein: P00395

MT-CO1, Cytochrome c oxidase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-CO1P00395 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MT-CO1P00395 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms