Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C6orf47O95873 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms