Protein–RNA interactions for Protein: O60493

SNX3, Sorting nexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX3O60493 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX3O60493 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX3O60493 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX3O60493 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX3O60493 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX3O60493 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX3O60493 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX3O60493 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX3O60493 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX3O60493 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX3O60493 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX3O60493 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX3O60493 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX3O60493 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX3O60493 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX3O60493 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX3O60493 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX3O60493 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX3O60493 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX3O60493 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX3O60493 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX3O60493 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX3O60493 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX3O60493 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX3O60493 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX3O60493 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX3O60493 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX3O60493 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX3O60493 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX3O60493 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX3O60493 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX3O60493 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX3O60493 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX3O60493 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX3O60493 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX3O60493 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX3O60493 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX3O60493 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX3O60493 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX3O60493 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX3O60493 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX3O60493 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX3O60493 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX3O60493 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX3O60493 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX3O60493 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX3O60493 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX3O60493 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX3O60493 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNX3O60493 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX3O60493 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX3O60493 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX3O60493 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX3O60493 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX3O60493 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX3O60493 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX3O60493 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX3O60493 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX3O60493 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX3O60493 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX3O60493 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX3O60493 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX3O60493 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX3O60493 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX3O60493 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX3O60493 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX3O60493 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX3O60493 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX3O60493 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX3O60493 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX3O60493 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX3O60493 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX3O60493 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX3O60493 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX3O60493 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX3O60493 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX3O60493 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX3O60493 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX3O60493 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX3O60493 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX3O60493 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX3O60493 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX3O60493 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX3O60493 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX3O60493 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX3O60493 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX3O60493 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX3O60493 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX3O60493 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX3O60493 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX3O60493 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX3O60493 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX3O60493 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX3O60493 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX3O60493 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX3O60493 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX3O60493 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX3O60493 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX3O60493 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX3O60493 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms