Protein–RNA interactions for Protein: O15164

TRIM24, Transcription intermediary factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM24O15164 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM24O15164 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM24O15164 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM24O15164 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM24O15164 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms