Protein–RNA interactions for Protein: F8VUJ3

POC1B-GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms