Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BECN2A8MW95 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms