Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
EFCAB5A4FU69 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
EFCAB5A4FU69 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC36.42■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
EFCAB5A4FU69 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
EFCAB5A4FU69 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
EFCAB5A4FU69 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
EFCAB5A4FU69 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
EFCAB5A4FU69 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
EFCAB5A4FU69 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
EFCAB5A4FU69 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
EFCAB5A4FU69 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
EFCAB5A4FU69 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
EFCAB5A4FU69 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
EFCAB5A4FU69 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
EFCAB5A4FU69 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
EFCAB5A4FU69 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
EFCAB5A4FU69 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
EFCAB5A4FU69 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
EFCAB5A4FU69 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
EFCAB5A4FU69 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
EFCAB5A4FU69 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms