Protein–RNA interactions for Protein: A0A088AWK7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A088AWK7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A088AWK7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A088AWK7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms