Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN7Q9Y6W3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN7Q9Y6W3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms