Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PAXBP1Q9Y5B6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms