Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCTD3Q9Y597 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms