Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DTX4Q9Y2E6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms