Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.6 ms