Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB23Q9ULC3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB23Q9ULC3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms