Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF3C4Q9UKN8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms