Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKB1

FBXW11, F-box/WD repeat-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW11Q9UKB1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXW11Q9UKB1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXW11Q9UKB1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms