Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD3Q9UJU5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD3Q9UJU5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms