Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NPC1L1Q9UHC9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NPC1L1Q9UHC9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NPC1L1Q9UHC9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NPC1L1Q9UHC9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NPC1L1Q9UHC9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NPC1L1Q9UHC9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NPC1L1Q9UHC9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NPC1L1Q9UHC9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
NPC1L1Q9UHC9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NPC1L1Q9UHC9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NPC1L1Q9UHC9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NPC1L1Q9UHC9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NPC1L1Q9UHC9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NPC1L1Q9UHC9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
NPC1L1Q9UHC9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NPC1L1Q9UHC9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NPC1L1Q9UHC9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NPC1L1Q9UHC9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NPC1L1Q9UHC9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NPC1L1Q9UHC9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NPC1L1Q9UHC9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NPC1L1Q9UHC9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NPC1L1Q9UHC9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NPC1L1Q9UHC9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NPC1L1Q9UHC9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NPC1L1Q9UHC9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NPC1L1Q9UHC9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NPC1L1Q9UHC9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NPC1L1Q9UHC9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NPC1L1Q9UHC9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NPC1L1Q9UHC9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
NPC1L1Q9UHC9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NPC1L1Q9UHC9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NPC1L1Q9UHC9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NPC1L1Q9UHC9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NPC1L1Q9UHC9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NPC1L1Q9UHC9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NPC1L1Q9UHC9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NPC1L1Q9UHC9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
NPC1L1Q9UHC9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NPC1L1Q9UHC9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
NPC1L1Q9UHC9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
NPC1L1Q9UHC9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NPC1L1Q9UHC9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms