Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTSFQ9UBX1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTSFQ9UBX1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTSFQ9UBX1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTSFQ9UBX1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTSFQ9UBX1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTSFQ9UBX1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSFQ9UBX1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSFQ9UBX1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSFQ9UBX1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSFQ9UBX1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSFQ9UBX1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSFQ9UBX1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSFQ9UBX1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSFQ9UBX1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSFQ9UBX1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSFQ9UBX1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSFQ9UBX1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSFQ9UBX1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSFQ9UBX1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSFQ9UBX1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSFQ9UBX1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTSFQ9UBX1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTSFQ9UBX1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTSFQ9UBX1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTSFQ9UBX1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTSFQ9UBX1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTSFQ9UBX1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTSFQ9UBX1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSFQ9UBX1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms