Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC17A6Q9P2U8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms