Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CDK12Q9NYV4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CDK12Q9NYV4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CDK12Q9NYV4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CDK12Q9NYV4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CDK12Q9NYV4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CDK12Q9NYV4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CDK12Q9NYV4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CDK12Q9NYV4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CDK12Q9NYV4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CDK12Q9NYV4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms