Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA2D2Q9NY47 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms